Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cabp1Q9JLK7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cabp1Q9JLK7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms