Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l2Q9JLG4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms