Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsmQ9JL96 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms