Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccr10Q9JL21 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccr10Q9JL21 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccr10Q9JL21 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Ccr10Q9JL21 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccr10Q9JL21 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccr10Q9JL21 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccr10Q9JL21 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccr10Q9JL21 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms