Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms