Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms