Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cyp39a1Q9JKJ9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms