Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms