Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra4Q9JJT2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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