Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc86Q9JJ89 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc86Q9JJ89 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc86Q9JJ89 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc86Q9JJ89 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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