Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird1Q9JI57 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms