Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aldh1a3Q9JHW9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms