Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Copz2Q9JHH9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Copz2Q9JHH9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Copz2Q9JHH9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Copz2Q9JHH9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Copz2Q9JHH9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Copz2Q9JHH9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms