Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cldn12Q9ET43 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn12Q9ET43 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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