Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Stx12Q9ER00 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx12Q9ER00 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx12Q9ER00 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms