Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ndst3Q9EQH7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ndst3Q9EQH7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ndst3Q9EQH7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ndst3Q9EQH7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ndst3Q9EQH7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndst3Q9EQH7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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