Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trmt112Q9DCG9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms