Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xab2Q9DCD2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xab2Q9DCD2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms