Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms