Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms