Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms