Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms