Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms