Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pop5Q9DB28 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pop5Q9DB28 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms