Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smco2Q9DA21 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms