Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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