Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot8Q9D8X5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms