Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Fam3aQ9D8T0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam3aQ9D8T0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Fam3aQ9D8T0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Fam3aQ9D8T0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Fam3aQ9D8T0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Fam3aQ9D8T0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Fam3aQ9D8T0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Fam3aQ9D8T0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam3aQ9D8T0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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