Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl4Q9D8E6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms