Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Q9D7E4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D7E4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms