Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsmce1Q9D720 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms