Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rtl8cQ9D6I0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rtl8cQ9D6I0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms