Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc39Q9D5Y1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc39Q9D5Y1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc39Q9D5Y1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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