Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ubxn11Q9D572 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ubxn11Q9D572 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubxn11Q9D572 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Ubxn11Q9D572 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ubxn11Q9D572 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ubxn11Q9D572 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Ubxn11Q9D572 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn11Q9D572 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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