Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms