Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc130Q9D516 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc130Q9D516 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms