Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms