Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhd1Q9D4J1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms