Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx29Q9D3S3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms