Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrnp35Q9D384 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrnp35Q9D384 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms