Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D2Q3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D2Q3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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