Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D1F3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D1F3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms