Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms