Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tspan11Q9D1D1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms