Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms