Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms