Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ss18l2Q9D174 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ss18l2Q9D174 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms