Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed3Q9D0L1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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