Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfc5Q9D0F6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rfc5Q9D0F6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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