Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2e1Q9D0D5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms